一、按照發病過程分類
四種人體瘧疾典型的臨床發作大體相似，可分為潛伏期、發冷(寒戰)期、發熱期、出汗期和間歇期。
1、潛伏期：從人體感染瘧原蟲到發病(口腔溫度超過37.8℃)，稱潛伏期。潛伏期包括整個紅外期和紅內期的第一個繁殖周期。一般間日瘧、卵形瘧14天，惡性瘧12天，三日瘧30天。感染原蟲量、株的不一，人體免疫力的差異，感染方式的不同均可造成不同的潛伏期。溫帶地區有所謂長潛伏期蟲株，可長達8～14個月。輸血感染潛伏期7～10天。胎傳瘧疾，潛伏期就更短。有一定免疫力的人或服過預防藥的人，潛伏期可延長。
間日瘧(tertian malaria)多急起，復發者尤然。初次感染者常有前驅癥狀，如乏力、倦怠、打呵欠；頭痛，四肢酸痛；食欲不振，腹部不適或腹瀉；不規則低熱。一般持續2～3天，長者一周。隨后轉為典型發作。分為三期。
2、發冷期或寒戰期：驟感畏寒，先為四肢末端發涼，迅覺背部、全身發冷。皮膚起雞皮疙瘩，口唇，指甲發紺，顏面蒼白，全身肌肉關節酸痛。進而全身發抖，牙齒打顫，有的人蓋幾床被子不能制止，持續約10分鐘，乃至一小時許，寒戰自然停止，體溫上升。此期患者常有重病感。
3、發熱期：冷感消失以后，面色轉紅，紫紺消失，體溫迅速上升，通常發冷越顯著，則體溫就愈高，可達40℃以上。高熱患者痛苦難忍。有的輾轉不安，呻呤不止；有的譫妄，撮空，甚至抽搐或不省人事；有的劇烈頭痛．頑固嘔吐。患者面赤。氣促；結膜充血；皮灼熱而干燥；脈洪而速；尿短而色深。多訴說心悸，口渴，欲冷飲。持續2-6小時，個別達10余小時。發作數次后唇鼻常見皰疹。
4、出汗期：高熱后期，顏面手心微汗，隨后遍及全身，大汗淋漓，衣服濕透，約2～3小時體溫降低，常至35.5℃。患者感覺舒適，但十分困倦，常安然入睡。一覺醒來，精神輕快，食欲恢復，又可照常工作。此刻進入間歇期。
5、間歇期：系指前后兩次發作的間隔時間。時間長短取決于蟲種和免疫力。就典型者的間歇期而言，惡性瘧病例很不規則，短僅數小時，長達24～48h，間日瘧和卵形瘧約為48h，三日瘧為72h。鏡檢所見原蟲除惡性瘧外，以大滋養體為主。
6、潛隱期和復發：間日瘧和卵形瘧還有潛隱期和復發；惡性瘧和三日瘧只有復燃，沒有復發。初發與復發以及前后兩次復發間隔的時間，分別稱為第1和第2潛隱期。未經足量高效血內裂殖體殺滅藥治療后所見的類似情況，統稱復燃。
二、按照疾病嚴重程度分類
兇險型瘧疾主要見于惡性瘧。其他三種瘧疾極少見到兇險型。
1、間日瘧：間日瘧多有前驅期。臨床急性發作以體溫超過38℃為準，發熱始于中午前后和晚上9點以前，偶見于深夜。開始一、二次癥狀較輕，熱度較低，隨后日益加重。間日瘧發作中常見單純皰疹，多見于口唇周圍，也可延及鼻和兩耳，偶見于肛門周圍和外陰部。間日瘧預后良好，早年有良性瘧之稱。
2、卵形癥：臨床癥狀與間日瘧相似。多數在下午5點以后或晚上發作。癥狀較輕，無明顯寒戰，發作次數一般在6次以內，易自愈，遠期復發少，常見無癥狀的帶蟲者。半數以上病例一開始就呈典型的間日熱型，熱度較低。
3、三日瘧：潛伏期18～35天，平均28天。通常無前驅期，發作前3～4天有疲倦、肌肉關節酸痛、寒冷感及頭痛，往往不易覺察而被忽視。多在午后發病，亦可見于中午時分。發冷、發熱和出汗三個時期較明顯，因退熱太快，有虛脫的可能。由于三日瘧原蟲的發育同步性較強，每72h為一發作周期亦較規則。三日瘧無復發，足量氯喹和奎寧均能予以根治。
4、惡性瘧：潛伏期6～27天，平均11天，多突然發病，無寒戰，僅有畏寒感。高熱者多見，常伴有頭痛、全身酸痛、惡心、嘔吐、貧血等。出汗期不明顯。熱型復雜，有的像間日瘧，隔天發作1次，與48h為一惡性瘧紅內期裂體增殖周期相符；有的每天發熱，熱型呈間歇型、弛張型或不規則型；有的持續高熱，發熱期往往長達20～36h；前后兩次發作的間歇期極短，致使體溫曲線呈“M”型。惡性瘧用高效裂殖體殺滅藥足量治療后，即可根治。若能及時治療，多數病例預后良好。
(1)腦型：多見于無免疫力而又未及時治療者。臨床上分為嗜睡、昏睡和昏迷三級。
(2)超高熱型：以起病較急、體溫迅速上升至41℃以上并持續不退為特點。
(3)厥冷型：病人軟弱無力，皮膚濕冷、蒼白或輕度發紺，可有陣發性上腹劇痛，常伴有頑固性嘔吐或水樣便，很快虛脫以至昏迷，多因循環衰竭而死亡。
(4)胃腸型：有明顯腹痛、腹瀉和里急后重感。本型是兇險型中預后較好、病死率較低一型。
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