要想治療腘窩囊腫之前，一定要及時的進行檢查，現如今常見的檢查腘窩囊腫的方法有超聲檢查、實驗室檢查、體格檢查以及影像學檢查。醫生診斷腘窩囊腫需要根據其檢查的結果、發病的原因、臨床表現等進行鑒別。動脈瘤、血管瘤、腘窩腫瘤等疾病與腘窩囊腫的檢查結果相似，醫生需要認真的進行分析。
目前治療腘窩囊腫最常采用的就是手術療法，手術治療指的是手術切除囊腫，手術治療在原則上是需要將腘窩囊腫切除的。部分腘窩囊腫患者也可以進行局部注射治療、穿刺治療和藥物治療等，對于治療方法的選擇需要認真的聽取醫生的意見，這樣才會有好的效果產生。
腘窩囊腫一般可以分為后天性和先天性兩種，一般先天性腘窩囊腫常見的發病人群是兒童。引發該疾病產生的原因也是比較復雜的，較為常見的發病原因有滑膜本身的疾病、免疫系統感染、藥物的刺激、環境的因素、慢性的損傷等。
腘窩囊腫這個疾病在患病的初期癥狀并不是很明顯，隨著患者病情的不斷發展，患者在行走的時候腿部會有腫脹的情況，當囊腫過大的時候還會妨礙到膝關節的伸屈活動，同時伴有體溫升高、精神萎靡、食欲不振以及四肢無力等多種并發癥的產生，這對患者的身體健康有著非常大的影響。
患有腘窩囊腫的患者在生活中需要特別的注意，要全面關注自己身體以及體征的變化，平時要多多休息，同時睡眠的時間一定要保證，要注意防寒與保暖的情況，根據氣候的變化來增減衣服。要樂觀的面對生活，注意加強營養的全面補充，才能夠緩解病情的發展。
中醫治療
腘窩囊腫患者很多合并有膝關節的骨性關節炎、軟骨損傷、游離體等。病變導致了腓腸肌內側頭滑膜囊的開口成為單向活瓣，關節液只能向滑膜囊單向流動，難以逆流，從而使滑膜囊積液增多，體積增大形成囊腫。
腘窩囊腫的穿刺抽吸和開放手術的復發率都很高。穿刺抽吸不能解除腘窩囊腫產生的病因，復發不難理解。開放手術失敗的原因可能是由于術中解剖變異、手術技巧等原因常常難以正確判斷囊腫的開口；有時甚至不能完整切除囊壁。
腘窩囊腫用中醫傳統膏藥外治，你可以對癥使用，比方說如果是骨性關節炎引起的可以同時貼敷腘窩囊腫和膝關節疼痛處，對癥的話2－3天就會有明顯好轉。
5西醫治療
兒童與成人的腘窩囊腫有一定差別，兒童常不與關節相通，極少合并關節內病變，一般可自愈。但成人常伴有關節內病變，手術切除囊腫的同時要治療關節內病變，否則易復發。原則上腘窩囊腫均應切除，術前行關節鏡檢查，大部分可用后內側切口或后側切口。術后行直腿抬高及股四頭肌練習。
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