登革熱由登革病毒感染引起，登革病毒屬B組蟲媒病毒，黃病毒科黃病毒屬（flavivirus）。病毒顆粒呈啞鈴狀（700×20~40nm）、棒狀或球形，球形直徑50nm。為單股正鏈RNA病毒，RNA分子量4.103kD。登革熱病毒核心為RNA與蛋白質組成的20面立體對稱的病毒顆粒，外層為兩種糖蛋白組成的包膜，包膜含有型和群特異性抗原，用中和試驗可鑒定其型別。病毒基因編碼3個結構蛋白和7個非結構蛋白（NS1、NS2a、NS2b、NS3、NS4a、NS4b和NS5）。3個結構蛋白分別為E蛋白（包膜蛋白）、C蛋白（核心殼蛋白）和M蛋白（膜蛋白）。E蛋白含有中和抗原和病毒的種、屬、型等特異性表位，可誘導機體產生中和抗體、血凝抑制抗體。此外，E蛋白還可能引起抗體依賴的增強感染作用（ADE）。C蛋白可能在蛋白質和RNA的相互作用中發揮作用。M蛋白與病毒感染能力的強弱有關。登革病毒可分為4個血清型，與其他B組蟲媒病毒如乙型腦炎病毒可交叉免疫反應。

登革病毒在1～3日齡新生小白鼠腦、猴腎細胞株、伊蚊胸肌及C6/36細胞株內生長良好，并產生恒定的細胞病變。

登革病毒對寒冷的抵抗力強，在人血清中貯存于普通冰箱可保持傳染性數周，負70℃可存活8年之久；但不耐熱，50℃30min或100℃2min均可滅活；不耐酸、不耐醚。用乙醚、紫外線或0.05%福爾馬林可以滅活。

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